实验八、紫外吸收法检测DNA 的浓度与纯度
一、实验目的
学会利用紫外分光光度计测定样品的吸光度,从而测出DNA 的浓度与纯度。
二、实验原理
DNA 的吸收峰在260nm ,蛋白质的吸收峰在280nm 。
1 μg/ml标准DNA 样品A 260=0.02,因此,A 260=1时,双链DNA 含
量为50μg/ml;单链DNA 与RNA 含量为40μg/ml;寡聚核苷酸的含量为30μg/ml。
一般来说,纯净的DNA 其A 260/A280的比值约为1.8,大于1.8表明
样品中RNA 污染严重,小于1.6说明有蛋白质或苯酚污染;纯净的RNA A260/A280的比值约为2.0,在样品中若含有蛋白质,会使A 260/A280的比值下降。
三、实验材料
紫外分光光度计、比色皿、移液枪、实验七中获得的质粒DNA
四、实验步骤
1、选取合适的按键。
待测定样品为dsDNA (如PCR 产物),按下键“7/dsDNA”。
待测定样品为ssDNA (如反转录合成的第一链cDNA 产物),按下键“8/ssDNA”。
待测定样品为RNA ,按下键“9/RNA”。
待测定样品为Oligo (如PCR 引物),按下键“6/Oligo”。
2、将空白对照置入样品孔。
注意:空白对照是空白液,并非所有情况都是水。例如,用Tris 溶液溶解DNA 样品,则要用Tris 液做空白对照。
3、按下 “Blank ”键。仪器记录空白对照,设置为0.000A 。
4、将样品置入样品孔,按下“Sample ”键,仪器显示样品的吸光度和浓度值,以及其他相关参考比值。
五、实验结果与分析
A 260/A280=1.118,DNA 浓度86.45。
A 260/A280小于1.6,说明蛋白质或苯酚污染严重,这可能是在制备质粒
DNA 时加入的酚/氯仿不足,或加入酚/氯仿后没有混合均匀等原因。 DNA 浓度偏低,可能是实验的多次弃上清过程中存在损耗。
六、思考题
问:利用紫外-可见分光光度计测得的结果比实际浓度偏高还是偏低?为什么?
答:核酸在波长 260 nm处有最高吸收峰。吸收紫外光的性质是嘌呤环和嘧啶环的共轭双键系统所具有的,所以嘌呤和嘧啶以及一切含有它们的物质,不论是核苷、核苷酸或核酸都有吸收紫外光的特性。但紫外法不能区分DNA 和RNA ,只能用来鉴定核酸的纯度和含量,故结果偏高。
实验八、紫外吸收法检测DNA 的浓度与纯度
一、实验目的
学会利用紫外分光光度计测定样品的吸光度,从而测出DNA 的浓度与纯度。
二、实验原理
DNA 的吸收峰在260nm ,蛋白质的吸收峰在280nm 。
1 μg/ml标准DNA 样品A 260=0.02,因此,A 260=1时,双链DNA 含
量为50μg/ml;单链DNA 与RNA 含量为40μg/ml;寡聚核苷酸的含量为30μg/ml。
一般来说,纯净的DNA 其A 260/A280的比值约为1.8,大于1.8表明
样品中RNA 污染严重,小于1.6说明有蛋白质或苯酚污染;纯净的RNA A260/A280的比值约为2.0,在样品中若含有蛋白质,会使A 260/A280的比值下降。
三、实验材料
紫外分光光度计、比色皿、移液枪、实验七中获得的质粒DNA
四、实验步骤
1、选取合适的按键。
待测定样品为dsDNA (如PCR 产物),按下键“7/dsDNA”。
待测定样品为ssDNA (如反转录合成的第一链cDNA 产物),按下键“8/ssDNA”。
待测定样品为RNA ,按下键“9/RNA”。
待测定样品为Oligo (如PCR 引物),按下键“6/Oligo”。
2、将空白对照置入样品孔。
注意:空白对照是空白液,并非所有情况都是水。例如,用Tris 溶液溶解DNA 样品,则要用Tris 液做空白对照。
3、按下 “Blank ”键。仪器记录空白对照,设置为0.000A 。
4、将样品置入样品孔,按下“Sample ”键,仪器显示样品的吸光度和浓度值,以及其他相关参考比值。
五、实验结果与分析
A 260/A280=1.118,DNA 浓度86.45。
A 260/A280小于1.6,说明蛋白质或苯酚污染严重,这可能是在制备质粒
DNA 时加入的酚/氯仿不足,或加入酚/氯仿后没有混合均匀等原因。 DNA 浓度偏低,可能是实验的多次弃上清过程中存在损耗。
六、思考题
问:利用紫外-可见分光光度计测得的结果比实际浓度偏高还是偏低?为什么?
答:核酸在波长 260 nm处有最高吸收峰。吸收紫外光的性质是嘌呤环和嘧啶环的共轭双键系统所具有的,所以嘌呤和嘧啶以及一切含有它们的物质,不论是核苷、核苷酸或核酸都有吸收紫外光的特性。但紫外法不能区分DNA 和RNA ,只能用来鉴定核酸的纯度和含量,故结果偏高。