定义：启动子是参与特定基因转录及其调控的DNA 序列。包含核心启动子区域和调控区域。核心启动子区域产生基础水平的转录，调控区域能够对不同的环境条件作出应答，对基因的表达水平做出相应的调节。
区域：启动子的范围非常大，可以包含转录起始位点上游2000bp ，有些特定基因的转录区内部也存在着转录因子的结合位点，因此也属于启动子范围。
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∙ 超级细菌耐药性基因多重PCR 检测 【原创】ensembl 改版后如何查找启动子 【原创】使用UCSC 查找一个基因的启动子序列（终） 【共享】如何查找基因启动子，外显子，内含子序列-最新的资料
Revelation 2005-05-07 11:23 消息 引用 收藏 分享
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加关注 ∙ • 【消息】ACEI + ARB， 你给血透患者用这样的组合吗？ 2005-05-07 11:29 消息 引用 收藏 分享 分享到哪里？ ∙ 复制网址 ∙ 新浪微博 ∙ 豆瓣社区 ∙ 腾讯微博 ∙ 开心网 ∙ 人人网 首先你可以看到该基因的参考序列（reference sequence）, 然后看到bcl-2的位置和基因组背景。bcl-2上游是PHLPP ，下游是FVT1基因。在这个长长的网页的最后是已经注册的Bcl-2基因的信息。
Revelation
0票 票数 Do One Thing, And Do It Well. Revelation edited on 2005-05-07 11:59 举报 ∙ 基因过表达 2005-05-07 11:35 消息 引用 收藏 分享 分享到哪里？ ∙ 复制网址 ∙ 新浪微博
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Revelation ∙ 豆瓣社区 ∙ 腾讯微博 ∙ 开心网 ∙ 人人网 看到基因组序列了么，点进去，根据序列信息自己就能定位转录起始位点，上游就是promoter 了，简单吧。不！我觉得麻烦。有更简单的方法么？有！注意到在网页的开头有这么个链接么？HGNC ：990
0票 票数 Do One Thing, And Do It Well. 举报 ∙ • 【消息】ACEI + ARB， 你给血透患者用这样的组合吗？ 2005-05-07 11:38 消息 引用 收藏 分享
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加关注 Do One Thing, And Do It Well. 举报 ∙ jetPEI DNA transfection reagent 2005-05-07 11:42 消息 引用 收藏 分享 分享到哪里？ ∙ 复制网址 ∙ 新浪微博 ∙ 豆瓣社区 ∙ 腾讯微博 ∙ 开心网 ∙ 人人网 呵呵，原来到了Ensemble 了，是Ensemble 的report 。列出了一堆令人兴奋的信息，太全了，只要是和这个基因相关的信息都能找到，包括SNP ，Isoforms ，等等等。我们感兴趣的是，这个连接“View genomic sequence for this gene with exons highlighted”
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∙ 罗氏NimbleGen 比较基因组杂交4x72K 芯片服务
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丁当加关注 2005-05-07 11:55 消息 引用 收藏 分享 分享到哪里？ ∙ 复制网址 ∙ 新浪微博 ∙ 豆瓣社区 ∙ 腾讯微博 ∙ 开心网 ∙ 人人网 把“5' Flanking sequence”的值改成5000bp ，哼！小样！！不行？10000，20000，。。。，靠，上一个基因的exon 都露出来，算了吧（最大值99999）。 如果保守估计可以做起始位点上游2000bp 内的区域，如果最大化估计，可以用起始位点上游至上有基因的最后一个exon 结尾处，算你狠！！！
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∙ • 【期刊导读】PM （北医）：塞来昔考用于鼻内镜术后疼痛的治疗
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∙ • 【求职】要么不当医生，要么就当庸医
lsgggg 2005-05-07 15:07 消息 引用 收藏 分享
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好文！
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得票 不过CXCR4的基因点了ensamble 后怎么没有结果呢？？ 0票 票数 举报 ∙ microRNA 及靶基因荧光素酶报告基因技术 2005-05-07 22:14 消息 引用 收藏 分享 分享到哪里？ ∙ 复制网址 ∙ 新浪微博 ∙ 豆瓣社区 ∙ 腾讯微博 ∙ 开心网 ∙ 人人网 这个我check 了一下，主要的问题出在NCBI 数据库和Ensemble 数据库之间的融合性上，也就是说目前二者之间的统一性与一致性还有一些小小的运转不灵。
解决方案：
246 1，我说过你可以看到四项：
1)Ensembl GeneView 2)GENATLAS 3)GeneCards 4)GeneClinics/GeneTests
丁当
第一项不行，其他的试试，当看到第三项GeneCards 的时候就会发现CXCR4的蛋
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2，点击进去会看到相应的核酸序列的Ensemble 注册号：ENSG[1**********]。点击去就回看到你要找的东西了。
3，这时候你会注意到Ensemble 给的ID 是CXCR4_HUMAN ，而NCBI 给的ID 是CXCR4, 用CXCR4检索Ensemble 数据库确实不能检索到任何东西，而用CXCR4_HUMAN 作关键词就可以。
所以，问题出在这两大数据库之间命名的一致性上，偌大的两个数据库，肯定大量存在这种问题，所以，我上门查找启动子的根本思路就是找到Ensemble 注册号，不要局限于一种方法，get it！！
Good Luck！！
定义：启动子是参与特定基因转录及其调控的DNA 序列。包含核心启动子区域和调控区域。核心启动子区域产生基础水平的转录，调控区域能够对不同的环境条件作出应答，对基因的表达水平做出相应的调节。
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所以，问题出在这两大数据库之间命名的一致性上，偌大的两个数据库，肯定大量存在这种问题，所以，我上门查找启动子的根本思路就是找到Ensemble 注册号，不要局限于一种方法，get it！！
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