感谢邀请，很高兴为你解答疑惑。有不对的地方还请指教。
首先我们要弄清楚一个问题，那就是你所指的导弹是哪一类。我就先来讲讲导弹的分类
按作战使用来分,导弹一般分为战略导弹和战术导弹两种。
按飞行方式,一般分为弹道导弹和巡航导弹.
“战斧”是一种战略巡航导弹.以前战略导弹多数是弹道导弹,而弹道导弹也多数是战略导弹,所以一般把战略弹道导弹简称为战略导弹,或弹道导弹.战术导弹大多是巡航导弹,所以“巡航”二字一般只在介绍战略导弹时出现.某些文章中,一般只是简单地说弹道导弹、战术弹道导弹、巡航导弹.这实际上是指战略弹道导弹、战术弹道导弹和战略巡航导弹.
现在,战略和战术的界限逐渐模糊,而且有的导弹既可以用于战略用途,又可以用于战术用途.比如“战斧”,既有战略导弹型号,也有攻击军舰的战术导弹型号。
按攻击的目标种类分,导弹分为防空导弹（攻击飞机）、反导导弹（攻击导弹,主要是弹道导弹）、反坦克导弹、反潜导弹、反辐射导弹（反雷达导弹）等.
最常用的分类方式是按发射点和目标位置来分.这种位置一般分为地面、水面（舰）、水下（潜）、空中4大类。按照这种方式分类,导弹本来应该有16种,但实际上并非这样。
首先,西方国家一般把地面和水面、水下统称为面,所以他们的导弹一般被分为面面导弹（SSM）、面空导弹（SAM）、空面导弹（ASM）、空空导弹（AAM）这4种。
地面发射、攻击地面目标的导弹发展历史最长（第一种导弹V-1就是地对地巡航导弹）、种类最多,在分类上发生了很大变化。我们现在所说的地地导弹,一般都是指地面发射、攻击地面固定目标的弹道导弹。比如说“飞毛腿”地地导弹,就是一种地对地战术弹道导弹。
至于地面发射、攻击地面活动目标的导弹,已经不被称为地地导弹,多数按照其目标种类来分.比如反坦克导弹、反辐射导弹。
某些种类的导弹比较少,比如潜潜导弹、潜空导弹,叫起来也不太顺口,所以就被称为潜射反潜导弹、潜射防空导弹。
按制导方式分类,也是常用的方式。
另外还有按导弹的某些性能分类的.比如按射程分,有远程导弹、中程导弹、近程导弹,甚至洲际导弹.对于不同种类的目标,中、远、近的界限也不同.防空导弹有一个射高的性能,因此就产生了低空导弹、中空导弹、高空导弹之分.对于反舰导弹,速度也是个关键性能,因此产生了亚音速反舰导弹和超音速反舰导弹之分.对于某些导弹,重量很重要,因此有了轻型导弹、中型导弹、重型导弹、便携式导弹之分。每一种导弹的功能，决定了它的飞行高度，同时也就决定了其遇见鸟类障碍的可能性。
哪么导弹飞行时会遇见鸟吗？答案是：会！只是可能性不大，说几种与鸟相遇可能性大的导弹，同时也说说保护的措施。1、对空导弹,由地面打击空中目标，由地面升空时，会和鸟类障碍相遇，所以其使用的是无线电近炸战斗部,按照目标的磁场,声场,静压场,电磁场特征触发,鸟不符合触发条件。2、巡航导弹,长时间超低空飞行,所以和鸟相遇是有可能发生的，考虑到飞鸟撞击问题,战斗部在巡航阶段不处于列装状态,抵达目标区才解锁,有严格的目标光学匹配识别系统确保它炸在该炸的地方。3、机载对地对面制导武器属于以上两种类型的综合运用。4、弹道导弹,升空和下落的过程中，遇鸟的可能性大，所以按照弹道末端-G值预设定高度起爆的,不到高度不爆。5、再来就是那些在1000米低空域条件下使用的各色低成本单兵导弹武器,比如肩射防空,肩射反坦克等等,这些武器的触发条件比较敏感,战斗部一旦发射就处于列装状态,真要在飞行过程中碰上小鸟青蛙什么的真的会被引爆，但一般情况下，这些短兵相接的地方，鸟儿都逃命去了。
其余的导弹不是不会遇见鸟，而是相比较而言可能性小些，所以也就不说了。
感谢邀请，很高兴为你解答疑惑。有不对的地方还请指教。
首先我们要弄清楚一个问题，那就是你所指的导弹是哪一类。我就先来讲讲导弹的分类
按作战使用来分,导弹一般分为战略导弹和战术导弹两种。
按飞行方式,一般分为弹道导弹和巡航导弹.
“战斧”是一种战略巡航导弹.以前战略导弹多数是弹道导弹,而弹道导弹也多数是战略导弹,所以一般把战略弹道导弹简称为战略导弹,或弹道导弹.战术导弹大多是巡航导弹,所以“巡航”二字一般只在介绍战略导弹时出现.某些文章中,一般只是简单地说弹道导弹、战术弹道导弹、巡航导弹.这实际上是指战略弹道导弹、战术弹道导弹和战略巡航导弹.
现在,战略和战术的界限逐渐模糊,而且有的导弹既可以用于战略用途,又可以用于战术用途.比如“战斧”,既有战略导弹型号,也有攻击军舰的战术导弹型号。
按攻击的目标种类分,导弹分为防空导弹（攻击飞机）、反导导弹（攻击导弹,主要是弹道导弹）、反坦克导弹、反潜导弹、反辐射导弹（反雷达导弹）等.
最常用的分类方式是按发射点和目标位置来分.这种位置一般分为地面、水面（舰）、水下（潜）、空中4大类。按照这种方式分类,导弹本来应该有16种,但实际上并非这样。
首先,西方国家一般把地面和水面、水下统称为面,所以他们的导弹一般被分为面面导弹（SSM）、面空导弹（SAM）、空面导弹（ASM）、空空导弹（AAM）这4种。
地面发射、攻击地面目标的导弹发展历史最长（第一种导弹V-1就是地对地巡航导弹）、种类最多,在分类上发生了很大变化。我们现在所说的地地导弹,一般都是指地面发射、攻击地面固定目标的弹道导弹。比如说“飞毛腿”地地导弹,就是一种地对地战术弹道导弹。
至于地面发射、攻击地面活动目标的导弹,已经不被称为地地导弹,多数按照其目标种类来分.比如反坦克导弹、反辐射导弹。
某些种类的导弹比较少,比如潜潜导弹、潜空导弹,叫起来也不太顺口,所以就被称为潜射反潜导弹、潜射防空导弹。
按制导方式分类,也是常用的方式。
另外还有按导弹的某些性能分类的.比如按射程分,有远程导弹、中程导弹、近程导弹,甚至洲际导弹.对于不同种类的目标,中、远、近的界限也不同.防空导弹有一个射高的性能,因此就产生了低空导弹、中空导弹、高空导弹之分.对于反舰导弹,速度也是个关键性能,因此产生了亚音速反舰导弹和超音速反舰导弹之分.对于某些导弹,重量很重要,因此有了轻型导弹、中型导弹、重型导弹、便携式导弹之分。每一种导弹的功能，决定了它的飞行高度，同时也就决定了其遇见鸟类障碍的可能性。
哪么导弹飞行时会遇见鸟吗？答案是：会！只是可能性不大，说几种与鸟相遇可能性大的导弹，同时也说说保护的措施。1、对空导弹,由地面打击空中目标，由地面升空时，会和鸟类障碍相遇，所以其使用的是无线电近炸战斗部,按照目标的磁场,声场,静压场,电磁场特征触发,鸟不符合触发条件。2、巡航导弹,长时间超低空飞行,所以和鸟相遇是有可能发生的，考虑到飞鸟撞击问题,战斗部在巡航阶段不处于列装状态,抵达目标区才解锁,有严格的目标光学匹配识别系统确保它炸在该炸的地方。3、机载对地对面制导武器属于以上两种类型的综合运用。4、弹道导弹,升空和下落的过程中，遇鸟的可能性大，所以按照弹道末端-G值预设定高度起爆的,不到高度不爆。5、再来就是那些在1000米低空域条件下使用的各色低成本单兵导弹武器,比如肩射防空,肩射反坦克等等,这些武器的触发条件比较敏感,战斗部一旦发射就处于列装状态,真要在飞行过程中碰上小鸟青蛙什么的真的会被引爆，但一般情况下，这些短兵相接的地方，鸟儿都逃命去了。
其余的导弹不是不会遇见鸟，而是相比较而言可能性小些，所以也就不说了。